Geronimo Stilton, cet intellectuel distrait, poltron et raffiné dirigeant le journal "L'écho des rongeurs", est désormais un agent spécial du DINO (le Département d'investigation sur la nature oubliée). Accompagné de son cousin Traquenard, de son amie paléontologue Karine von Fossilen, de la scientifique Genny Geiger et de l'explorateur au sens de l'orientation catastrophique Lennox Jungle, la souris au nom fromagé s'affaire ainsi à protéger l'île Météore, un lieu secret où vivent encore de nombreux dinosaures. Dans cet opus: Tous les agents du Dino sont mobilisés pour retrouver la professeure Genny Geiger qui a disparu. Geronimo et ses amis sillonnent l'île Météore jusqu'à la vallée de l'extinction, où ils la trouvent enfin, prisonnière de Boston Blake, leur ennemi juré. De plus, l'affreux pirate détient des bébés stégosaures sur lesquels il compte pour récolter des pierres précieuses.